bélflóra összetétele az emésztőtraktus területén más és más. Egészségesekben csak a vastagbélben telepednek meg mikroorganizmusok.
A gyomorban savas a kémhatás. Itt főleg a Streptococcusok és aStaphilococcusok igen kis mennyiségben Lactobacillusok is megtalálhatók. A gyomorban található a Helicobacter pylori is. Jelenléte fekélyre vagy gyomorrák kialakulására hajlamosít.
A vékonybél felső szakaszán a bélflóra hasonló a gyomoréhoz, Gram-pozitív alakok és anaerobok egyaránt megtalálhatók, lejjebb pedig Gram-negatív baktériumokkal is találkozhatunk.(Bifidobacteriumok,Bacterides,család,Clostridiumok,és a Fusobacteriumok)
A vastagbélben döntő az anaerobok, oxigént nem igénylő baktériumok túlsúlya, a fentieken kívül az Enterococcusok,Enterobacteriaceae,Eubacteriumok,Peptococcusok,Peptostreptococcusok, az fordulnak elő.
Sokan a bélben található gombákat a normál flóra tagjainak tartják de ez nem bizonyított. Az emberek 70-80%-ánál a bélrendszerben kis mennyiségben kimutathatók gombák, de betegségtüneteket nem okoznak.
Bélflora-wikipedia